背景

安装synapser R包时需要PythonEmbedInR R包依赖，安装这个依赖命令如下

install.packages("PythonEmbedInR",destdir = '/home/xhs/Rpack/download',repos=c("http://cran.fhcrc.org", "http://ran.synapse.org"))

安装失败，报错如下

一大串的编译错误

​​/usr/lib/libpython3.6m.a(myreadline.o): relocation R_X86_64_32 against ​xxxxxxx’ can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC.`

解决方案

这个是一个共享库的问题，直接去/usr/lib/目录下重名后，再安装

sudo mv libpython3.6m.a libpython3.6m.a.bak

再返回rstudio安装PythonEmbedInR，成功无报错。