背景 之前使用mongodb存储数据 关机后重启启动不了，报错 2024-12-26T11:59:45.098+0800 E STORAGE \journal\WiredTigerTmplog.0000000001 to journal\WiredTigerLog.0000000001: file

一、生存分析的基本概念 生存时间：从规定的观察起点至事件终点出现所经历的时间长度。 生存数据：① 完全数据：准确的生存时间；② 删失数据/截尾数据：由于某种原因无法观察到事件终点出现的数据。 删失数据的原因包括：1）研究结束时终点事件未发生；2）失访；3）研究对象因其他原因死亡或无法耐受而终止观察。

背景 前面我们下载了新版tcga的rnaseq 数据,同时下载了样本的临床数据，此次就可以对临床数据进行整理了。 一、临床数据整理 rm(list = ls()) #### 魔幻操作，一键清空~ getwd() setwd('C:/Users/Administrator/project_gdc2

背景 前面我们下载了新版tcga的rnaseq counts数据。 接下来就利用TCGA数据库的LIHC数据进行数据整理，获得我们进行差异分析需要的counts、TPM等数据。 一、处理代码 ### 解压数据，创建存储文件夹---- # 我们使用命令行下载的，直接就是解压后的文件目录，可以跳过这一步

背景 TCGA（The Cancer Genome Atlas）GDC（Genomic Data Commons）data portal 2.0是2024年全新推出的癌症基因组数据共享平台，此版本界面采用了最先进的Web技术，为用户提供了更加直观、互动性强的数据浏览体验。新版界面的设计注重用户友好性