生生不息

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语言基础

Linux环境安装R包Rglpk报错

Linux环境安装R包Rglpk报错

背景 使用服务器的R语言,安装poppr包过程中,报错: In file included from vendor/cigraph/src/community/optimal_modularity.c:32: vendor/cigraph/src/internal/glpk_support.h:39
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2024-10-03
pycharm安装模块出错 Retrying (Retry(total=0, connect=None, read=None, redirect=None, status=None))

pycharm安装模块出错 Retrying (Retry(total=0, connect=None, read=None, redirect=None, status=None))

背景 新电脑刚安装python3.7.2和pycharm社区版,使用pandas模块,安装时出现错误 提示网络错误 Retrying (Retry(total=0, connect=None, read=None, redirect=None, status=None)) 解决方法 出现该错误信息是
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2024-10-03
Python打开读文件:UnicodeDecodeError: ‘utf-8‘ codec can‘t decode byte 0xed in position 7014: invalid conti

Python打开读文件:UnicodeDecodeError: ‘utf-8‘ codec can‘t decode byte 0xed in position 7014: invalid conti

背景 Python用open()打开文件,读取其中内容时,报错说编码错误,'utf-8' 编码不能给字节0xed编码。 UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0xed in position 7014: invalid continu
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2024-10-03
解决Bioconductor version cannot be validated

解决Bioconductor version cannot be validated

背景 最近新电脑,安装R包有的需要使用BiocManager进行安装。过去使用BiocManager安装R包就是手到擒来,轻轻松松。但是这次装个R包居然遇到了很多困难。 报错内容 这次的报错主要是: Error: Bioconductor version cannot be validated; n
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2024-10-03
word,tag = line.strip().split()报错

word,tag = line.strip().split()报错

背景 python小白,取值做字典分割报错。 原语句: word,tag = line.strip('\n').split() 报错 ValueError: too many values to unpack (expected 2) 解决方法 改为: v = line.strip('\n')
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2024-10-03
R报错-导入中文数据时invalid multibyte string at ''

R报错-导入中文数据时invalid multibyte string at ''

背景 最近在做一个文本分析的作业,需要导入中文,但是导入的时候遇到了如下的错误,直接是无法读取,甚至连乱码的机会都不给我。 解决方案 查了一会发现是文件的问题,因为我的R已经是调过格式的了,所以系统应该是没有问题的哈~ 主要原因是之前导入的csv的格式是(.csv),但事实上只要把文件重新导出成CS
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2024-10-02
recompile with -fPIC报错解决

recompile with -fPIC报错解决

背景 安装synapser R包时需要PythonEmbedInR R包依赖,安装这个依赖命令如下 install.packages("PythonEmbedInR",destdir = '/home/xhs/Rpack/download',repos=c("http://cran.fhcrc.or
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2024-10-02
terra包加载报错解决

terra包加载报错解决

背景 最近要分析单细胞转录组学数据,使用monocle3包前需要安装一些依赖,其中包含terra包,使用conda环境安装后,加载时报错。 library(terra) ​​unable to load shared object '/share/Software/miniconda3/envs/r
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2024-10-02